锰砂滤料常用于除铁、除锰的过滤装置。长时间使用后生成铁垢会影响传热、腐蚀设备。可利用锰砂过滤器的反冲洗功能达到去除净化的目的。但是，由于锰砂滤料表面的活性滤膜结构比较松散，容易被破坏。所以一般不要用空气反洗，只要压差不影响出力就行了。
当压差大到一定的时候，简单反洗一下没必要搞空气反洗，破坏了表面的膜，重新建立起来需要大量的时间。所以锰砂滤料安全彻底的反洗一个季度搞一次就足够了，每次反洗的时间不宜太长，控制在5-15分钟就好。之所以不要频繁进行，是因为在产品的表面是会有一层催化氧化膜，它对于提高过滤的作用帮助很大。如果频繁进行反洗的话，就会洗掉这层膜会很不利。
锰砂滤料粒径过大时滤料间孔隙大。过滤时，杂质穿透深度大，容易穿透滤层，影响出水水质；反洗时，只有较大的反洗强度才能松动滤层，否则会影响反洗效果。反洗不彻底，会留下许多隐患，如泥渣残留在滤层，残留泥渣结块，影响过滤时水流的均匀性。过滤时影响杂质穿透深度，增加水流阻力，造成水头损失增加过快，出力下降等.
锰砂滤料反冲洗时对过滤水的具体要求如下：
一般来说滤料的容重决定了滤池的反冲洗强度，天然锰砂滤料(二氧化锰含量达到35%)的容重为2.0吨/m3，反冲洗强度要求20L/S㎡，反冲洗时间为10分钟。覆合锰砂滤料的容重为1.58/m3。反冲洗强度要求12L/S?㎡，反冲洗时间为5分钟。
1、锰砂滤料的接触氧化能力和吸附能力不仅决定除铁锰效果，还对过滤水的含氧量有要求。地下水含氧量的多少取决于滤前曝气系统的设置，覆合锰砂过滤要求含氧量为水中铁锰离子浓度之和的1.5倍。
天然锰砂过滤含氧量要求为3倍。虹吸滤池若使用天然锰砂，曝气环节的设计还需要进一步增加溶氧措施。
2、国家规范天然锰砂滤料设计滤速为5~8米/小时，而覆合锰砂的设计滤速可以达到10米/小时，滤速的取值决定滤池的设计面积，使用天然锰砂的滤池比使用覆合锰砂的滤池面积大25%({10-8}/ 8×100%=25%)，即滤池土建面积需要增加25%才能达到同样的产水量。
