锰砂滤料除锰采用的是接触氧化法。接触氧化除锰工艺流程比较简单，水经简单曝气之后进入除锰滤池，锰砂滤料表面的锰质活性滤膜的作用下，二价锰离子被水中的溶解氧氧化成为二氧化锰，并且在滤料表面，使滤膜得到更新，此过程是自催化反应。
接触氧化除锰与接触氧化除铁的工艺非常类似，都是简单曝气后直接过滤，水力停留时间短。但由于铁锰性质略有不同，因为影响因素也有所不同。铁的氧化还原电位比锰低，二价锰较难被氧化成四价锰，所以其滤速比除铁滤速低，一般为8-10m/h。而且二价铁对四价锰成为还原剂，大大阻碍二价锰的氧化。
用于地下水除铁和除锰的天然锰砂滤料，其锰的形态应以氧化锰为主。含锰量（以MnO2计，下同）不应小于35%的天然锰砂滤料，既可用于地下水除铁，又可用于地下水除锰。
锰砂滤料正确的填装方法如下：
1、配水系统安装完毕以后，先将滤池内杂物全部清除，并疏通配水孔眼和配水缝隙，然后再用反冲洗法检查配水系统是否符合设计要求。
2.、在滤池内壁按承托料和锰砂滤料的各层顶高画水平线，作为铺装高度标记。
3、仔细检查不同粒径范围的承托料，按其粒径范围，从大到小依次清洗，以备铺装。
4、铺装最下一层承托料时，应注意避免损坏滤池的配水系统。待装承托料应吊运到池内，再行铺撒;或者使池内充水至排水槽顶，再向水中均匀撒料，然后排水，使水面降至该层顶面高度水平上线，用锹铺匀。铺装人员不应直接在承托料上站立或行走，而宜站在木板上操作;在池内的操作人员应尽量少，以免造成锰砂滤料的移动。在下一层铺装完成后，才能铺装上一层承托料。
5.、每层承托料的厚度应准确、均匀，用锹或刮板刮动表面，使其接近于水平面，高度应与铺装高度标记水平线相吻合。
6.、在铺完2～4mm的承托料锰砂滤料后，应用该滤池上限冲洗强度冲洗，以排除承托料中的泥沙。
7.、承托料全部分层铺装就位后，采用从池顶向水中均匀撒料的方法，撒入预计数量的锰砂滤料(包括应刮除的轻物质和小于指定下限粒径的细颗粒)，然后进行冲洗。冲洗后刮除轻物质和小于指定下限粒径的颗粒。按上述方法操作后，如锰砂滤料厚度达不到规定的数值，应重复上述操作直到符合要求为止。
